Методичну раду гiмназiї - iнтернату очолює директор. Членами методичної ради є заступники директора та голови методичних об'єднань. На засiданнях методичної ради обговорюються i приймаються рiшення з найважливiших питань роботи гiмназiї-iнтернату.

Завдання методичної роботи:

• удосконалення роботи всiх структурних пiдроздiлiв методичного комплексу;
• розробка та впровадження новiтнiх технологiй навчання;
• пiдвищення професiйного рiвня вчителiв;
• вивчення, узагальнення, впровадження кращого педагогiчного досвiду шкiл України та країн близького та далекого зарубiжжя;
• розробка експериментальних навчальних програм, методичних посiбникiв

Проблеми, над якими працює педагогiчний колектив гiмназiї - iнтернату №299:

• навчання учнiв самостiйному пошуку знань, вмiнню критично мислити та висловлювати особисту думку;
• розвиток iнтелектуальних здiбностей учнiв у процесi навчання та виховання;
• втiлення рiзноманiтних форм та методiв iндивiдуалiзацiї навчання в учбовий процес;
• виховання нацiональної самосвiдомостi, вiдродження єврейської мови, культури, традицiй;
• розвиток i формування соцiально зрiлої, працелюбної, творчої особистостi, громадянина України.